Program Studi Pendidikan Islam Anak Usia Dini (PIAUD) di STAINU Purworejo diselenggarakan mulai tahun 2016 dengan nama Program Studi Pendidikan Guru Raudhatul Athfal (PGRA) berdasar Surat Keputusan Direktur Jenderal Pendidikan Islam Kementerian Agama RI Nomor 2013 Tahun 2016 yang ditetapkan pada tanggal 11 April 2016.
Tujuh bulan setelah pengesahan penyelenggaraan, Program Studi Pendidikan Guru Raudhatul Athfal (PGRA) mengalami perubahan nomenklatur menjadi Program Studi Pendidikan Islam Anak Usia Dini (PIAUD) berdasar Surat Keputusan Direktur Jenderal Pendidikan Islam Kementerian Agama RI Nomor 6943 Tahun 2016 tentang Perubahan dan Penyesusai Nomenklatur Program Studi pada Perguruan Tinggi Keagamaan Islam (PTKI) yang ditetapkan pada tanggal 7 Desember 2016.
Adapun periodesasi kepemimpinan pada Program Studi ini adalah sebagai berikut:
- Periode pertama (2016 – 2018): Prawidya Lestari, M.Pd. sebagai ketua Program Studi.
- Periode kedua (2018 – 2019): M. Nurul Huda, S.Hum., M.A. sebagai ketua Program Studi.
- Periode ketiga (2019 – 2024): Nurjanah, S.Sos.I., M.Pd., sebagai ketua Program Studi.
Program Studi Pendidikan Islam Anak Usia Dini yang unggul dalam IPTEKS dan Ilmu Keislaman yang berwawasan Kebangsaan pada tahun 2025 
